东源县疾病预防控制中心是隶属东源县卫生健康局管理的副科级公益一类事业单位。主要职能是负责辖区内疾病预防控制的组织与实施、传染病疫情调查与防控、艾滋病高危人群干预、卫生检验监测与评价、国家免疫规划管理、突发公共卫生事件应急处置、重点地方病防治及疟疾监测、职业卫生和基本公共卫生服务、健康宣教与促进、对基层指导和培训等工作。县疾控中心始终认真贯彻执行新时期预防为主的卫生工作方针，不断适应新形势，从机构建设、人才培养、组织管理和重点疾病防控等方面狠下功夫，有效地控制了各类传染病及地方病发生和流行。2021年至2023年获评“河源市先进基层党组织”、“县直和省市驻东源县单位综合考核优秀单位”等多项荣誉称号。

　　现有人员52人，技术人员占在职人员89%。下设办公室、免疫管理科、应急管理与传染病预防控制科、公共卫生科、检验科、卫生监测科、慢性非传染性疾病控制科及质量技术科共7科1室。

　　疾控办公大楼位于东源县城农林小区，建筑面积3783平方米，四、五楼为检验中心，检验用房1500平方，分设理化和微生物检验，现有实时荧光定量PCR仪、全自动微生物鉴定系统、多病原快速筛查鉴定系统、流式细胞仪、原子吸收分光光谱仪、气相色谱仪、电感耦合等离子体质谱仪等仪器设备。县疾控中心疫苗配送实行全程冷链无缝对接；获得广东省实验室认定、食品检验机构资质认定证书；对突发公共卫生事件和传染病疫情的处置及时、有效，有力保障了人民群众身体健康和社会稳定。